Le Fonds Routier assure le financement, d'une part, des programmes de protection du patrimoine routier national, des programmes de prévention et de sécurité routières, d'entretien du réseau routier, et d'autre part, des opérations de réhabilitation et d'aménagement des routes.
Le Fonds Routier exerce sa mission par le biais de trois guichets distincts et indépendants que sont :
- Le guichet "Entretien"
- Le guichet "Investissement "
- Le guichet "Indemnisation" depuis la loi de 2022.
Etablissement public administratif de type particulier par rapport à ses organes de gestion, à la rémunération et aux avantages de son personnel, ainsi qu'aux règles de tenue de sa comptabilité, le Fonds Routier est doté de la personnalité juridique et jouit de l'autonomie de gestion.
Il est ainsi placé sous la double tutelle du Ministre en charge des finances et du Ministre en charge des routes. Et son objet reste fonction de ses guichets (Entretien, Investissement et Indemnisation.